Die Aussage kann ich nicht ganz nachvollziehen, wenn sie denn so getätigt wurde. Wenn man tatsächlich nach defekten Sektoren suchen will, dann muss man chkdsk mit den Parametern /F und /R ausführen, wenn nur mit /R wird auch tatsächlich der Datenträger auf defekte Sektoren gescannt.
Auch hier fehlt noch ein wenig Vorgeschichte: warum wolltest du denn überhaupt die Festplatte auf defekte Sektoren durchsuchen? Falls du solche vermutest, wäre es sinnvoller, sie mit dem Testprogramm des Herstellers der Festplatte zu testen. Sollten dabei defekte Sektoren gemeldet werden, tausch die Platte aus und installier auf der neuen Platte Windows neu.
Du kannst mit Tools wie Crystal Disk Info auslesen, ob die Platte jetzt schon Probleme meldet:
https://crystalmark.info/en/software/crystaldiskinfo/
Die Standard-Version als .zip Download reicht, einfach entpacken und starten. Sollte für die Platte "Vorsicht" oder schlechteres gemeldet werden, ist sie defekt.