Hola, Irene:
Sin ver lo que hay es difícil conocer la causa, pero me atrevería a decir que es la posición de los mismos. si no puedes controlarla colócalos En línea con el texto, o, mucho mejor, no uses cuadros de texto. A lo sumo, tablas sin bordes, aunque esto depende del tipo de documento.
Acabo de verlo, pasarlos a pdf es imprimir. PDF, de Printable Document Format, es una impresora, aunque virtual. Quiero decir que el problema es de tu impresora física. Compruébalo en otro equipo, con otra impresora física o con XPS, que es otra impresora virtual.