Hola! Lo más probable es que tu OneDrive tenga aplicada una política de retención . En ese escenario, OneDrive puede impedir el borrado, y por eso aunque intentes borrar desde la web o desde la PC no libera espacio. Esto también explica que la papelera esté vacía pero el almacenamiento siga al 100%
Intenta eliminar primero los archivos dentro de la carpeta y después la carpeta, si aun borrando un archivo te sale el mismo error, entonces ya no es un fallo local: necesitas escalarlo con el administrador de Microsoft 365 / TI de tu institución para que revisen.