Databricks Runtime 6.5 pour Genomics (non prise en charge)

Databricks a publié cette image en avril 2020.

Databricks Runtime 6.5 pour Genomics est une version de Databricks Runtime 6.5 (non prise en charge) optimisée pour l’utilisation de données génomiques et biomédicales. Il s’agit d’un composant de la plateforme d’analytique unifiée Databricks pour Genomics.

Pour plus d’informations, notamment les instructions relatives à la création d’un cluster Databricks Runtime pour Genomics, consultez Guide Genomics . Pour plus d’informations sur le développement d’applications génomiques, consultez le Guide Genomics.

Nouvelles fonctionnalités

Databricks Runtime 6.5 pour Genomics est basé sur Databricks Runtime 6.5. Pour plus d’informations sur les nouveautés de Databricks Runtime 6.5, consultez les notes de publication Databricks Runtime 6.5 (non pris en charge).

Améliorations

Avant la version 0.2.33, la grêle avait un bogue qui empêchait les utilisateurs d’exécuter plusieurs blocs-notes de grêle sur le même cluster. Nous avons résolu ce problème dans Open source et mis à jour la version installée de grêle.

Bibliothèques

Les bibliothèques suivantes incluses dans Databricks Runtime 6.5 pour Genomics diffèrent de celles incluses dans Databricks Runtime 6.5.

Bibliothèque Version
ADAM 0.30.0
Hadoop-bam 7.9.2
Grêle 0.2.33
GATK 4.0.11.0
samtools 1,9
VEP 96