Se Windows è già installato su entrambe le unità, non è possibile configurare un sistema dual boot. È necessario modificare l'ordine di avvio nel BIOS per poter scegliere quale versione di Windows avviare all'accensione del PC.
Per creare un sistema dual boot automatico, è necessario reinstallare uno dei sistemi operativi; successivamente, il programma di installazione di Windows utilizzerà la partizione di avvio sull'altra unità per creare automaticamente un sistema dual boot.