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Panoramica delle trasformazioni OMOP nelle soluzioni per i dati sanitari

L'obiettivo di implementare qualsiasi modello di dati comune è stabilire la standardizzazione e semplificare la strutturazione, l'archiviazione, la condivisione, lo scambio e l'utilizzo dei dati. Nelle soluzioni per i dati sanitari è possibile usare le trasformazioni OMOP per distribuire il modello di dati comune OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) nell'ambiente lakehouse di Fabric. Questa distribuzione fornisce ai ricercatori all'interno della community OMOP l'accesso alla scalabilità estesa di OneLake e alle funzionalità di intelligenza artificiale della piattaforma Fabric. La configurazione consente un'esecuzione efficiente e affidabile di analisi standardizzate per studi osservazionali a livello di paziente e popolazione.

Tramite la distribuzione di OMOP CDM in Fabric usando pipeline predefinite, è possibile usare i notebook forniti per costruire modelli statistici, condurre studi sulla distribuzione della popolazione e usare report di Power BI per confrontare visivamente i vari interventi e i relativi effetti sui risultati dei pazienti. Queste funzionalità analitiche consentono ai ricercatori di eseguire analisi comparativhe, ad esempio la valutazione delle procedure e delle esposizioni dei farmaci o l'analisi delle correlazioni tra le esposizioni dei farmaci e le occorrenze di condizioni. Per informazioni di riferimento e indicazioni, la funzionalità fornisce anche notebook di esempio per questi scenari.

Le trasformazioni OMOP sono una funzionalità facoltativa nelle soluzioni per i dati sanitari in Microsoft Fabric. È possibile decidere se usarlo o meno, a seconda delle esigenze o degli scenari specifici.

Per informazioni su come distribuire, configurare e usare la funzionalità delle trasformazioni OMOP, vedere:

Dopo aver trasformato i dati nel modello OMOP, è anche possibile eseguire query e analizzare i dati usando la funzionalità Individua e creare coorti (anteprima) nelle soluzioni dati sanitarie.

Elementi inclusi in OMOP CDM

Le soluzioni per i dati sanitari in Microsoft Fabric implementano la versione 5.4 di OMOP Common Data Model con particolare attenzione al mapping delle risorse cliniche FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) alle tabelle OMOP corrispondenti in Fabric. Lo schema OMOP CDM completo con tutte le sue tabelle è popolato nel lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. Tuttavia, solo le tabelle cliniche sono mappate alle risorse FHIR.

  • Le tabelle in Economia sanitaria standardizzata non rientrano nell'ambito e non sono mappate a risorse FHIR. Non verranno popolati dopo l'esecuzione delle pipeline di trasformazione dalla lakehouse healthcare#_msft_silver alla lakehouse healthcare#_msft_gold_omop.

  • Sono inclusi vocabolari standardizzati per mappare terminologie e codici dalle risorse cliniche FHIR ai concetti standard OMOP corrispondenti nel dominio clinico.

    Il set di dati DiEna contiene riferimenti a vocabolari specifici del dominio.

  • I vocabolari standard inclusi nella versione corrente sono SNOMED-CT (Sistema Nomenclatura della Medicina - Termini Clinici), LOINC (Identificatori Logici di Osservazione, Nomi e Codici), e RxNorm.

Immagine che mostra la rappresentazione del modello di dati comune OMOP.