すでにご存知かもしれませんが、Surface および Surface 2 は従来の Windows からあるようなデスクトップアプリを動かすことはできません。
ストアアプリではユーザーの明確な同意なしにローカルのファイルを操作することができないなど、安全側に制限がかける設計となっているため、バックグラウンドで勝手にローカルのファイルを同期するというようなことはできませんので、サードパーティーのストレージサービスではお望みのことはできません。
反面、OneDrive は Windows RT に統合されているものですので、そういった制限を受けずに使うことができます。
Surface および Surface 2 で自動同期などの使い勝手を求めるのであれば、現状は OneDrive を使うしか手がないはずです。
デスクトップアプリでカバーすることを考えるのであれば、Surface Pro など、通常の Windows 8 系を動かせるノート PC、タブレットを検討する必要があります。