安藤坂の Pochi さん、こんにちは。
マイクロソフト コミュニティへの投稿ありがとうございます。
手元の環境でも確認してみたところ、Windows 10 バージョン 1709 では 安藤坂の Pochi さんと同様でしたが、Windows 10 バージョン 1703 だと IE の検索バーやメモ帳は無限に点滅の状態でした。
1703 でも Microsoft Edge や Cortana、[設定] 画面、天気アプリなどでは 3 ~ 4 回点滅でストップしてしまったので、UWP アプリの場合は元々そうなっていて、バージョン 1709 ではそれがデスクトップ アプリも含めて全てに適用されたのかも知れないですね。
コミュニティの検索欄については 1709, 1703 ともに 10 回でストップしたのですが、1703 で Google Chrome で開いてみるとこちらは無限点滅でした。(1709 で Chrome は環境が無く確認できませんでした)
設定やコントロールパネルで、関連のありそうな IME や簡単設定、マウスの項目にそれらしいものがないか、Web ページ側で IME のカーソル点滅回数を制御する方法があるのか、バージョン 1709 で動作変更になった意図や経緯、など、調べてみても情報を見つけることはできなかったです。。。