안녕하세요.
말씀하신 대로 OneDrive의 경우 버전 관리 기능으로 인하여 위와 같이 PST 파일의 위치를 OneDrive 동기화 폴더로 지정할 경우 위와 같은 문제를 겪을 수 있습니다.
메일 서버가 지원할 경우 POP/SMTP(POP3)가 아닌 Exchange, IMAP/SMTP 방식의 사용을 권장해 드리지만 POP3만 사용이 가능하시다면 아래와 같이 PST 파일을 OneDrive 동기화 폴더가 아닌 다른 폴더에 위치하도록 변경을 하시고 백업이 필요할 경우 PST 파일만 별도로 OneDrive에 폴더에 복사하여 사용하시는 것을 권장해 드립니다.
OneDrive에서 Outlook.pst 데이터 파일을 제거하는 방법
How to remove an Outlook .pst data file from OneDrive
감사합니다.