Wydaje mi się, że podczas odświeżania powinieneś zostać o tym ostrzeżony, zob. pomoc http://windows.microsoft.com/pl-pl/windows-8/restore-refresh-reset-pc
Aplikacje dostarczone z komputerem lub zainstalowane ze Sklepu Windows zostaną ponownie zainstalowane, ale wszystkie aplikacje zainstalowane z innych witryn sieci Web i dysków DVD zostaną usunięte. Po odświeżeniu komputera systemWindows umieści na pulpicie listę usuniętych aplikacji.
W tym wypadku możesz chyba jedynie skorzystać z listy usuniętych aplikacji i ręcznie je zainstalować. Punkty przywracania tworzą się w różnych sytuacjach, więc być może posiadasz jakiś sprzed niedługiego czasu utworzony przy innej okazji (np. aktualizacji systemu), jednak wydaje mi się, że nie pozwolą one na przywrócenie aplikacji po odświeżeniu systemu.