Olá
Bem vindo à Comunidade Microsoft Windows
Tudo bem, Fernando? Pelo relato o problema pode estar relacionado à configuração da GPO de instalação de programas. Verifique se a política está configurada corretamente e se os pacotes .msi estão acessíveis para os usuários do domínio. Além disso, pode ser que a instalação esteja causando conflitos com outros processos em execução no sistema, o que pode estar causando a lentidão na inicialização. Recomendo que você verifique o registro de eventos do sistema para identificar possíveis erros ou conflitos durante a inicialização.