Olá, obrigado por entrar em contato com o Microsoft Q&A.
Acho que a JetBrains oferece um instalador separado para dispositivos PyCharm executando processadores ARM64. Você já verificou este link?
https://www.jetbrains.com/help/pycharm/installation-guide.html#standalone
Isenção de responsabilidade padrão: este é um site que não é da Microsoft. A página parece estar fornecendo informações precisas e seguras. Cuidado com os anúncios no site que podem anunciar produtos frequentemente classificados como PUP (Produtos Potencialmente Indesejados). Pesquise minuciosamente qualquer produto anunciado no site antes de decidir baixá-lo e instalá-lo.
Como o problema parece ser específico do próprio software da JetBrains e não está relacionado aos programas do Windows ou da Microsoft, seria melhor entrar em contato diretamente com o suporte da JetBrains. Sua equipe deve ter informações mais detalhadas e etapas de solução de problemas para esse problema específico.