Здравствуйте, Степан.
Меня зовут Игорь. Мне приятно помогать другим, и я постараюсь помочь вам.
Если будете подключать флешку к работающему зараженному компьютеру, то заражение флешки возможно. Вам надо подключить флешку к выключенному ноутбуку и при включении выбрать загрузке с флешки. Не забудьте в начале установки удалить с диска все разделы. А лучше запустить командную строку и очистить диск с помощью diskpart.