Здравствуйте.
Да, со временем система "обрастает". И не всегда понятно, куда ушло свободное место... Посмотрите статью MVP: https://www.outsidethebox.ms/17937/ возможно информация, изложенная в ней окажется полезной.
Из личного опыта могу добавить, что помимо "стандартной" Очистки диска дополнительно чищу вручную содержимое вот этих папок:
c:\WINDOWS\SoftwareDistribution\Download\
c:\WINDOWS\Temp\
c:\WINDOWS\SystemTemp\
c:\Users<Имя_профиля>\AppData\Local\Temp\
примерно раз в 2 недели и после крупных обновлений. Также примерно раз в 1-2 месяца выполняю очистку системного хранилища (папка WinSxS). Для этого использую bat-файл с командами:
Dism.exe /Online /Cleanup-Image /AnalyzeComponentStore
Dism.exe /Online /Cleanup-Image /StartComponentCleanup
Dism.exe /Online /Cleanup-Image /StartComponentCleanup /ResetBase
Dism.exe /Online /Cleanup-Image /AnalyzeComponentStore
pause
запуская его от имени Администратора.
При регулярном обслуживании на диске С занято около 25-27 Гб (весь диск 64 Гб, так что за местом смотрю внимательно).