Не очень хорошо....
Вам лучше сделать так:
- Отключить все жесткие диски от ПК, оставив ssd.
- Выполнить чистую установку на ssd, с удалением всех(!) разделов на нем и созданием на освободившемся месте одного, который и указать в качестве места установки.
- Подключить остальные жесткие диски только после полной установки ОС на ssd.
- Сохранить нужные Вам данные с жестких дисков и выпонить их форматирование.
Тогда уйдет и текущая проблема и не будет проблем, связанных с загрузкой ОС, если один из жестких дисков будет удален или выйдет из строя.