Здравствуйте.
Да, все Ваши файлы, а так же большинство программ сохраняться. Но, к сожалению, не все, а только те, которые будут совместимы с новой операционной системой.
В любом случае, перед обновлением настоятельно рекомендуется сделать резервную копию всех важных для Вас файлов, чтобы не потерять их в случае какого либо непредвиденного сбоя.