Размещение файлов на съемном диске - это не решение проблемы. Более того, для этого еще нужно иметь внешний диск и потом каждый раз подключать его.
Тогда уж можно держать специальную папку на диске С (чтобы на любом компьютере адрес ссылки был одинаков), в которой будут собраны все подобные проекты, и сделать ярлыки, например, на рабочий стол. Однако, при этом нужно еще иметь диск С, что в общем случае
не обязательно.
Если возможность создания относительных ссылок в OneNote, как и во многих других приложениях офиса, просто отсутствует, то озвученные выше предложения будут, наверное, лучшими решениями.
Но всё это очень не удобно и в общем случае не решает проблему.