Пакет ресурсов GATK

Статья
02/19/2024

Пакет ресурсов GATK — это набор стандартных файлов для работы с данными ресеквенирования генома человека с использованием GATK.

Примечание.

Корпорация Майкрософт предоставляет Открытые наборы данных Azure как есть. Корпорация Майкрософт не предоставляет никаких гарантий (явных или подразумеваемых) и не определяет никаких условий в связи с использованием этих наборов данных. В рамках, допускаемых местным законодательством, корпорация Майкрософт отказывается от ответственности за ущерб и убытки (в том числе прямые, косвенные, специальные, опосредованные, случайные и штрафные), понесенные в результате использования вами этих наборов данных.

Этот набор данных предоставляется на тех же условиях, на которых корпорация Майкрософт получила исходные данные. Этот набор может включать данные, полученные от корпорации Майкрософт.

Источник данных

Этот набор данных является зеркальным по отношению к хранилищу данных по адресу https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle

Объемы данных и частота обновления

datasetgatkbestpractices : 542 ГБ
datasetgatklegacybundles : 61 ГБ
datasetgatktestdata : 2 ТБ
datasetpublicbroadref: 477 ГБ
datasetbroadpublic: 3 ТБ

Наборы данных обновляются ежемесячно в течение первой недели каждого месяца.

Расположение хранилища

Этот набор данных хранится в регионах Azure "Западная часть США 2" и "Центрально-западная часть США". Для обеспечения приближенности рекомендуется выделять вычислительные ресурсы в регионе "Западная часть США 2" или "Центрально-западная часть США".

Доступ к данным

datasetgatkbestpractices

Западная часть США 2: https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=6SaDfKtXAIfdpO%2BkvNA%2FsTNmNij%2Byh%2F%2F%2Bf98WAUqs7I%3D
datasetgatklegacybundles

Западная часть США 2: https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=xBfxOPBqHKUCszzwbNCBYF0k9osTQjKnZbEjXCW7gU0%3D
datasetgatktestdata

Западная часть США 2: https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=fzLts1Q2vKjuvR7g50vE4HteEHBxTcJbNvf%2FZCeDMO4%3D
datasetpublicbroadref

Западная часть США 2: https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=DQxmjB4D1lAfOW9AxIWbXwZx6ksbwjlNkixw597JnvQ%3D

Южная центральная часть США: "https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset"

Маркер SAS: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A56%3A11Z&se=2029-02-13T19%3A56%3A00Z&sr=c=rl&sig=oGiNUGZ08PaabHVNtIiVEpJ1kcyqcL6ZadQcuN2ns%2FM%3D
datasetbroadpublic

Западная часть США 2: https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: ?sv=2020-04-08&si=prod&sr=c&sig=u%2Bg2Ab7WKZEGiAkwlj6nKiEeZ5wdoJb10Az7uUwis%2Fg%3D

Южная центральная часть США: "https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset"

Маркер SAS: ?sv=2023-01-03&st=2024-02-12T19%3A58%3A33Z&se=2029-02-13T19%3A58%3A00Z&sr=c=c=rl&sig=C2lDhe1uwu%2FJnC9rbQO65G6%2BdEUQ%2Fl0VheXrlnIQVAs%3D

Условия использования

Посетите официальный веб-сайт, посвященный пакету ресурсов GATK.

Контакт