Die Meldung taucht immer dann auf, wenn das Dateisystem einen Fehler meldet. Wenn es gemeldet wird, sollte es auch durchgeführt werden. Die Prüfung abzubrechen oder zu umgehen ist nicht sinnvoll, da dann der Fehler nicht beseitigt wird.
Wenn trotz durchlaufender Prüfung die Meldung immer wieder auftaucht, teste die Festplatte mit dem Testprogramm des Plattenherstellers. Eventuell liegt dann nämlich ein Fehler der Festplatte vor.
Es reicht übrigens, hier Fragen einmal zu stellen... ;-)