OpenCRAVAT: Open Custom Ranked Analysis of Variants Toolkit

OpenCRAVAT ist ein Python-Paket, das genomische Varianten interpretiert, einschließlich deren Auswirkung, Annotation und Bewertung. Die modulare Architektur von OpenCRAVAT enthält eine Vielzahl von Analysemodulen und Annotationsressourcen, die je nach Anforderungen einer bestimmten Studie ausgewählt, installiert und ausgeführt werden können.

Weitere Informationen zu den Daten finden Sie unter OpenCravat.

Hinweis

Microsoft stellt Datasets der Plattform Azure Open Datasets auf einer „As is“-Basis (d. h. ohne Mängelgewähr) zur Verfügung. Microsoft übernimmt weder ausdrücklich noch stillschweigend die Gewährleistung für Ihre Nutzung der Datasets und sichert keinerlei Garantien oder Bedingungen zu. Soweit nach örtlich anwendbarem Recht zulässig, lehnt Microsoft jegliche Haftung für Schäden oder Verluste ab. Dies schließt direkte, indirekte, besondere oder zufällige Schäden oder Verluste sowie Folge- und Strafschäden und damit verbundene Verluste ein, die sich aus Ihrer Nutzung der Datasets ergeben.

Für die Bereitstellung dieses Datasets gelten die ursprünglichen Nutzungsbedingungen, unter denen Microsoft die Quelldaten bezogen hat. Das Dataset kann Daten von Microsoft enthalten.

Datenquelle

Bei diesem Dataset handelt es sich um eine Spiegelung der Daten unter https://store.opencravat.org und https://run.opencravat.org.

Datenvolumes und Aktualisierungshäufigkeit

Dieses Dataset umfasst 500 GB an Daten und wird täglich aktualisiert.

Speicherort

Dieses Dataset wird in den Azure-Regionen „USA, Westen 2“ und „USA, Westen-Mitte“ gespeichert. Aus Gründen der Affinität wird die Zuweisung von Computeressourcen in die Regionen „USA, Westen 2“ oder „USA, Westen-Mitte“ empfohlen.

Datenzugriff

USA, Westen 2: https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset

USA, Westen-Mitte: ‚ https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset ‘

SAS-Token: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Nutzungsbedingungen

OpenCRAVAT ist mit einer GPLv3-Lizenz verfügbar. Die meisten Datenquellen sind für die nicht kommerzielle Verwendung freigegeben. Wenden Sie sich an die institutionellen Kontakte für die jeweilige Datenquelle, wenn Sie diese für kommerzielle Zwecke einsetzen möchten.

Contact

rkarchi1@jhmi.edu

Nächste Schritte

Machen Sie sich mit den restlichen Datasets im Open Datasets-Katalog vertraut.