Los updates o actualizaciones siempre son recomendados en el sistema operativo ya que van apareciendo a medida que se encuentran vulnerabilidades o se añaden mejoras. El concepto de que si tienes mucho espacio ocupado en el disco el equipo se ralentizará queda ya obsoleto en sistemas como Windows Vista o Windows 7. Siempre y cuando el espacio libre del disco sea considerable, no debería afectar el rendimiento.
Las actualizaciones de Windows son generalmente del 1 al 7 día de cada mes cuando se lanzan, luego pueden tratarse de otro tipo de actualizaciones las que se presenten (otros software, controladores, etc).
En referencia a tu consulta del título las actualizaciones ocupan espacio en tu disco. Generalmente no se reemplaza ninguna aplicación sino que se añade una nueva, se mejora.
Espero que te sea de utilidad la aclaración o comentario realizado.
Saludos!
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