$Recycle.bin es una carpeta de sistema que te aparece en todos los volúmenes o discos locales. si tienes un disco externo usb y éste es detectado como disco local y no como medio extraible, entonces también te aparecerá. todas esas $Recycle.bin de cada volumen están conectadas comúnmente con la Papelera de Reciclaje que te aparece en el escritorio, y si vas a la papelera de reciclaje podrás configurar cada una de ellas como quieras en cada volumen
ve a la Papelera de Reciclaje del escritorio, botón derecho Propiedades y mira si te aparece la letra de tu disco externo. eso significa que tu disco es un disco local, no un medio extraible
si te aparecieran 2 desktop.ini sería normal, uno para la carpeta usuario y otro para la pública
ahora bien, si lo deseas puedes escanear el equipo en busca de virus, así te quedarás más tranquilo:
Quitar malware prevalente específico con la Herramienta de ...
saludos