Eso es normal... por supuesto que Windows va a ocupar casi en su totalidad el uso del disco para instalar actualizaciones. Lo anormal sería que el uso del disco esté al 100% constantemente después de que no hayan actualizaciones pendientes y aun así el servicio de actualizaciones (o cualquier otro servicio/programa) esté usando el disco de esa manera.
Si el distribuidor te está dando una imagen tan desactualizada de Windows, pues es hora de exigirle que instalen una imagen más actualizada. Pierdes más tiempo actualizando una versión tan antigua de Windows... O haz tu propia imagen y no dependas del distribuidor. Hasta podrías inyectarle a dicha imagen los programas que ocupas y así automatizar ese proceso. Lo único que debes asegurarte es de instalar la misma edición de Windows con la que vienen los equipos para no tener problemas con el licenciamiento.
No sé, me parece que le quieres buscar una salida fácil a un problema que no es de Windows en vez de tratar de isolar cuál es la raiz del problema. Yo en mi organización he implementado Windows 10 en más de 300 equipos y no tengo ningún problema de uso del 100%.
Saludos.