Hola, Juan Sebastián:
Si usted comenta que eliminó esa carpeta de la amenaza y que la carpeta por tanto ya no existe, tiene toda la pinta de ser un bugeo del Historial de Protección de Amenazas de Windows Defender.
En ese caso, realice el siguiente paso:
Abra el Explorador de Archivos o cualquier carpeta de su PC. En el menú Vista marque la casilla de verificación "Elementos ocultos"
A continuación, diríjase a la siguiente ruta:
C:\ProgramData\Microsoft\Windows Defender\Scans\History\Service\
Si existe la subcarpeta DetectionHistory, acceda a ella y elimine todas las subcarpetas que aparezcan.
Compruebe si Windows Defender, sigue informando de que existe la amenaza o ya no lo hace.
Un saludo.