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Se aplica a: 
SQL Server SSIS Integration Runtime en Azure Data Factory
En SQL Server Data Tools (SSDT), puede eliminar los paquetes guardados en el sistema de archivos. Si elimina un paquete, se elimina de forma permanente y no puede restaurarse en un proyecto de Integration Services.
Nota
Si quiere quitar paquetes de un proyecto de Integration Services, pero usarlos en otros proyectos, debe usar la opción Excluir del proyecto en lugar de la opción Eliminar.
Para eliminar un paquete en Business Intelligence
En SQL Server Data Tools (SSDT), abra el proyecto de Integration Services que contiene el paquete que desea eliminar.
En el Explorador de soluciones, haga clic con el botón derecho en el paquete y, luego, haga clic en Eliminar.
Haga clic en Aceptar para confirmar la eliminación o haga clic en Cancelar para conservar el paquete.