Configuration du modèle Trial Matcher

Trial Matcher inclut un graphique de connaissances intégré, qui utilise des essais cliniques issus de clinicaltrials.gov et est mis à jour régulièrement.

Lorsque vous faites correspondre des patients à des essais cliniques, vous pouvez définir une liste de filtres pour interroger un sous-ensemble d’essais cliniques. Chaque filtre peut être défini en fonction de trial conditions, types, recruitment statuses, sponsors, phases, purposes, facility names, locations ou trial IDs.

• La spécification de plusieurs valeurs pour la même catégorie de filtre entraîne un jeu d’essais cliniques qui est une union des deux jeux.

Remarque

Les exemples de cet article sont basés sur la version API : 2023-03-01-(préversion). Il peut y avoir des modifications entre les versions de l’API. Pour obtenir une version spécifique de l’API, veuillez utiliser la référence à l’API REST pour afficher une description complète.

Dans la configuration suivante, le modèle interroge les essais cliniques qui se trouvent dans l’état de recrutement recruiting ou not yet recruiting.

"recruitmentStatuses": ["recruiting", "notYetRecruiting"]

• La spécification de plusieurs catégories de filtres entraîne un jeu d’essais cliniques qui est la combinaison des jeux. Dans le cas suivant, seuls les essais cliniques pour le diabète qui recrutent dans l’Illinois sont interrogés. Le fait de laisser une catégorie vide ne limite pas les essais par cette catégorie.

"registryFilters": [
    {
        "conditions": [
            "Diabetes"
        ],
        "sources": [
            "clinicaltrials.gov"
        ],
        "facilityLocations": [
            {
                "country": "United States",
                "state": "IL"
            }
        ],
        "recruitmentStatuses": [
            "recruiting"
        ]
    }
]

Preuve

La preuve indique si la sortie du modèle doit inclure des preuves pour les inférences. La valeur par défaut est true. Pour chaque essai clinique auquel le modèle a conclu que le patient n’est pas éligible, le modèle retourne les informations pertinentes sur les patients et les critères d’éligibilité qui ont été utilisés pour exclure le patient de l’essai.

{
    "type": "trialEligibility",
    "evidence": [
        {
            "eligibilityCriteriaEvidence": "Inclusion: Patient must have an Eastern Cooperative Oncology Group performance status of 0 or 1 The diagnosis of invasive adenocarcinoma of the breast must have been made by core needle biopsy.",
            "patientInfoEvidence": {
                "system": "http://www.nlm.nih.gov/research/umls",
                "code": "C1512162",
                "name": "Eastern Cooperative Oncology Group",
                "value": "2"
            }
        },
        {
            "eligibilityCriteriaEvidence": "Inclusion: Blood counts performed within 6 weeks prior to initiating chemotherapy must meet the following criteria: absolute neutrophil count must be greater than or equal 1200 / mm3 ;, platelet count must be greater than or equal 100,000 / mm3 ; and",
            "patientInfoEvidence": {
                "system": "http://www.nlm.nih.gov/research/umls",
                "code": "C0032181",
                "name": "Platelet Count measurement",
                "value": "75000"
            }
        }
    ],
    "id": "NCT03412643",
    "source": "clinicaltrials.gov",
    "value": "Ineligible",
}

Commentaires

Le détail indique si le modèle doit retourner des informations sur l’essai clinique. La valeur par défaut est false. Si la valeur est True, le modèle retourne des informations sur l’essai clinique, notamment Title, Phase, Type, Recruitment status, Sponsors, Contacts et Facilities.

Si vous utilisez la correspondance progressive, verbose est généralement utilisé dans la dernière étape du processus de qualification, avant l’affichage des résultats de l’essai.

{
    "type": "trialEligibility",
    "id": "NCT03513939",
    "source": "clinicaltrials.gov",
    "metadata": {
        "phases": [
            "phase1",
            "phase2"
        ],
        "studyType": "interventional",
        "recruitmentStatus": "recruiting",
        "sponsors": [
            "Sernova Corp",
            "CTI Clinical Trial and Consulting Services",
            "Juvenile Diabetes Research Foundation",
            "University of Chicago"
        ],
        "contacts": [
            {
                "name": "Frank, MD, PhD",
                "email": "frank@surgery.uchicago.edu",
                "phone": "999-702-2447"
            }
        ],
        "facilities": [
            {
                "name": "University of Chicago Medical Center",
                "city": "Chicago",
                "state": "Illinois",
                "country": "United States"
            }
        ]
    },
    "value": "Eligible",
    "description": "A Safety, Tolerability and Efficacy Study of Sernova's Cell Pouch™ for Clinical Islet Transplantation",
}

Ajout d’essais cliniques personnalisés

Trial Matcher peut recevoir les critères d’éligibilité d’un essai clinique au format d’un essai personnalisé. L’utilisateur du service doit fournir la section des critères d’éligibilité de l’essai clinique personnalisé, sous forme de texte, dans un format similaire au format de clinicaltrials.gov (même mise en retrait et structure). Un essai clinique personnalisé peut être fourni comme essai unique pour correspondre à un patient, en tant que liste d’essais personnalisés ou en tant qu’ajout à un graphique de connaissances clinicaltrials.gov. Pour fournir un essai clinique personnalisé, l’entrée du service Trial Matcher doit inclure ClinicalTrialRegisteryFilter.sources avec la valeur custom.

{
   "Configuration":{
      "ClinicalTrials":{
         "CustomTrials":[
            {
               "Id":"CustomTrial1",
               "EligibilityCriteriaText":"INCLUSION CRITERIA:\n\n  1. Patients diagnosed with Diabetes\n\n2. patients diagnosed with cancer\n\nEXCLUSION CRITERIA:\n\n1. patients with RET gene alteration\n\n 2. patients taking Aspirin\n\n3. patients treated with Chemotherapy\n\n",
               "Demographics":{
                  "AcceptedSex":"female",
                  "acceptedAgeRange":{
                     "MinimumAge":{
                        "Unit":"Years",
                        "Value":0
                     },
                     "MaximumAge":{
                        "Unit":"Years",
                        "Value":100
                     }
                  }
               },
               "Metadata":{
                  "Phases":[
                     "Phase1"
                  ],
                  "StudyType":"Interventional",
                  "RecruitmentStatus":"Recruiting",
                  "Conditions":[
                     "Diabetes"
                  ],
                  "Sponsors":[
                     "sponsor1",
                     "sponsor2"
                  ],
                  "Contacts":[
                     {
                        "Name":"contact1",
                        "Email":"email1",
                        "Phone":"01"
                     },
                     {
                        "Name":"contact2",
                        "Email":"email2",
                        "Phone":"03"
                     }
                  ]
               }
            }
         ]
      },
      "Verbose":true,
      "IncludeEvidence":true
   },
   "Patients":[
      {
         "Id":"Patient1",
         "Info":{
            "Gender":"Female",
            "BirthDate":"2002-07-19T10:58:02.7500649+00:00",
            "ClinicalInfo":[
               {
                  "System":"http://www.nlm.nih.gov/research/umls",
                  "Code":"C0011849",
                  "Name":"Diabetes",
                  "Value":"True;EntityType:DIAGNOSIS"
               },
               {
                  "System":"http://www.nlm.nih.gov/research/umls",
                  "Code":"C0004057",
                  "Name":"aspirin",
                  "Value":"False;EntityType:MedicationName"
               }
            ]
         }
      }
   ]
}

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