Base de données ImmuneCODE

Remarque

Mise à jour importante mai 2025 : Chère communauté, nous aimerions vous informer d’une modification à venir concernant les jeux de données ouverts Genomics actuellement disponibles via Azure. Après un examen attentif, nous avons décidé de nous concentrer sur de nouvelles initiatives qui serviront mieux notre communauté et s’aligneront sur nos objectifs à long terme. Par conséquent, l’accès aux jeux de données ouverts Genomics sur Azure sera déconseillé au cours des prochains mois. Nous comprenons que ces jeux de données ont été utiles pour la recherche, le développement et l’apprentissage, et nous apprécions profondément les contributions et l’engagement de notre communauté au fil du temps. Merci de votre compréhension et de votre soutien.

La base de données ImmuneCODE™, qui comprend des centaines de millions de séquences de récepteurs de cellules T (TCR) provenant de plus de 1 400 sujets exposés au virus SARS-CoV-2 ou infecté par lui, et plus de 160 000 TCR haute fiabilité propres au SARS-CoV-2. La base de données est accessible gratuitement. Ses données peuvent être analysées pour aider les initiatives mondiales visant à comprendre la réponse immunitaire au virus SARS-CoV-2 et à élaborer des interventions inédites. Pour en savoir plus sur le jeu de données, consultez la publication associée.

Les derniers jeux de données ImmuneCODE disponibles contiennent : Release 002.

• Les 1 486 sujets exposés au virus SARSCoV-2 ou infectés par lui : ImmuneCODE-Repertoires-002.2.
• Les exemples de métadonnées : ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.tsv (572 KB) Release 002.2.
• Les TCR haute fiabilité propres au SARS-CoV-2 (plus de 160 000) : ImmuneCODE-MIRA-Release 002.1.
• Les exemples de métadonnées : ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.tsv (352 KB) Release 002.2.

Remarque

Microsoft fournit Azure Open Datasets « en l’état ». Microsoft n’offre aucune garantie, expresse ou implicite, ni de conditions relatives à votre utilisation des jeux de données. Dans la mesure autorisée par votre droit local, Microsoft décline toute responsabilité pour les dommages ou pertes, y compris directs, consécutifs, spéciaux, indirects ou punitifs, résultant de votre utilisation des jeux de données.

Ce jeu de données est fourni selon les conditions initiales par lesquelles Microsoft a reçu les données sources. Le jeu de données peut inclure des données provenant de Microsoft.

Source de données

Ce jeu de données est une copie de https://clients.adaptivebiotech.com/pub/covid-2020

Volumes de données et fréquence de mise à jour

Ce jeu de données contient approximativement 228 Go de données et est mis à jour quotidiennement.

Emplacement de stockage

Ce jeu de données est stocké dans la région Azure USA Ouest 2. L’allocation de ressources de calcul dans la région USA Ouest 2 est recommandée pour des raisons d’affinité.

Accès aux données

USA Ouest 2 : « https://dataset1000genomes.blob.core.windows.net/dataset  »

USA Centre-Ouest : « https://dataset1000genomes-secondary.blob.core.windows.net/dataset  »

Conditions d’utilisation

Pour en savoir plus sur les conditions d’utilisation des données, consultez la publication et les Conditions d’utilisation.

Contact

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7418738/

Étapes suivantes

Consultez les autres jeux de données du catalogue Open Datasets.