Vue d’ensemble de l’analyse OMOP dans les solutions de données de santé (version préliminaire)
[Cet article fait partie de la documentation en version préliminaire et peut faire l’objet de modifications.]
L’objectif de la mise en œuvre de tout modèle de données commun est d’établir une standardisation et de rationaliser la structuration, le stockage, le partage, l’échange et l’utilisation des données. Dans les solutions de données de santé (version préliminaire), vous pouvez utiliser l’analyse OMOP pour déployer le Common Data Model (CDM) de l’Observational Medical Outcomes Partnership (OMOP) dans l’environnement de la lakehouse Fabric. Ce déploiement permet aux chercheurs de la OMOP accès à la communauté à grande échelle de OneLake et aux capacités d’IA de la plateforme Fabric. La configuration permet une exécution efficace et fiable d’analyses standardisées pour les études observationnelles au niveau des patients et de la population.
En déployant le OMOP CDM sur Fabric à l’aide de pipelines prédéfinis, les utilisateurs peuvent utiliser les blocs-notes fournis pour construire des modèles statistiques, mener des études sur la répartition de la population et utiliser Power BI des rapports pour comparer visuellement diverses interventions et leurs effets sur les résultats pour les patients. Ces capacités analytiques permettent aux chercheurs d’effectuer des analyses comparatives, telles que l’évaluation de différentes procédures et expositions à des médicaments, ou l’examen des corrélations entre les expositions aux médicaments et les occurrences de pathologies. À titre de référence et de conseils, la fonctionnalité fournit également des exemples de blocs-notes pour ces scénarios.
L’analyse OMOP est une fonctionnalité facultative dans les solutions de données de santé dans Microsoft Fabric (version préliminaire). Vous avez la possibilité de décider de l’utiliser ou non, en fonction de vos besoins ou scénarios spécifiques.
Pour savoir comment déployer, configurer et utiliser la fonctionnalité d'analyse OMOP, consultez :
- déployer et configurer OMOP analyses
- Utiliser OMOP analytics
- Utiliser les OMOP exemples de notebooks Analytics
Éléments inclus dans OMOP CDM
Les solutions de données de santé dans Microsoft Fabric (version préliminaire) mettent en œuvre la OMOP Common Data Model version v5.4 en mettant l’accent sur la cartographie des ressources cliniques Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) aux OMOP tables correspondantes dans Fabric. Le schéma CDM OMOP complet avec toutes ses tables est renseigné dans la lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. Cependant, seules les tables cliniques sont mappées aux ressources FHIR.
Les tableaux sous Économie de la santé standardisée sont hors de portée et ne sont mappés à aucune ressource FHIR. Ils ne seront pas renseignés une fois les pipelines de transformation exécutés depuis healthcare#_msft_silver lakehouse vers healthcare#_msft_gold_omop lakehouse.
Nous incluons des vocabulaires standardisés pour prendre en charge la cartographie des terminologies et des codes référencés dans les ressources cliniques du FHIR avec les concepts standard correspondants OMOP dans le domaine clinique.
Le Athena jeu de données contient des références à des vocabulaires spécifiques au domaine.
Les vocabulaires standard inclus dans la version préliminaire sont SNOMED-CT (Nomenclature Systématisée de la Médecine – Termes Cliniques), LOINC (Identifiants, noms et codes d’observation logiques), et RxNorm.
