Visto che le icone ci sono, visto che le vedi dal gestore file io proverei a fare sul desktop tasto destro e Visualizza -> Disponi icone automaticamente.
Non è che per caso ha cambiato risoluzione allo schermo o fatto uno spostamento / adattamento schermo / duplicazione doppio monitor etc? Potrebbero essere andate (se ne avevi poche) oltre lo schermo? E' per questo che ti suggerisco di provare con la disposizione automatica.
Se invece ha fatto lo sdoppiamento dello schermo (o altri termini che dipendono alle volte dal driver della scheda grafica) potrebbero essere state piazzate nel "secondo" schermo (che suppongo tu non abbia). Rimettendo lo schermo unico potrebbero ritornare nel desktop principale. A me è successo su un portatile che alle volte sdoppiavo su un monitor esterno per avere nello schermo del portatile una cosa e nello schermo esterno un'altra.
Ciao