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Gli agenti Microsoft Discovery supportano compiti di ricerca scientifica, dalla progettazione molecolare e analisi proteica alla simulazione dei materiali e alla revisione della letteratura. Sfoglia le categorie per trovare agenti per la tua indagine.
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Usa la skill Discovery agent sul sito Discovery GitHub per aiutarti a installare rapidamente agenti.
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Sfoglia gli agenti per categoria di ricerca. Ogni tabella riassume gli agenti e i loro tag di abilità.
| Category | Compiti di ricerca | Agenti |
|---|---|---|
| Chimica e scoperta di farmaci | Proprietà molecolari, dati chimici, docking, generazione molecolare e pianificazione della sintesi | 27 |
| Ingegneria e hardware | Fluidodinamica, simulazione dei circuiti e analisi hardware digitale | 5 |
| Genomica e biologia dei sistemi | Analisi di sequenzie, genomica, espressione genica e modellazione di reti biochimiche | 17 |
| Materiali e simulazione | Dati sui materiali, strutture cristalline, chimica quantistica e dinamica molecolare | 15 |
| Proteine e struttura | Previsione, progettazione, analisi e simulazione biomolecolare della struttura delle proteine | 18 |
| Ricerca e dati | Ricerca bibliografica, dati di trial clinici, analisi dei brevetti e validazione statistica | 7 |
| Spettroscopia e metabolomica | Elaborazione dello spettro di massa e identificazione dei metaboliti | 2 |
Chimica e scoperta di farmaci
Questi agenti supportano il recupero di dati chimici, l'analisi e la generazione molecolare, la previsione delle proprietà, il docking e la pianificazione della sintesi.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| AiZynthFinder | Pianifica le rotte di sintesi a partire dalle molecole target fino ai precursori disponibili. |
drug-discovery, retrosynthesis, trained-model |
| AutoDock Vina | Predice il legame proteina-ligando e supporta lo screening virtuale. |
drug-discovery, molecule-docking, virtual-screening |
| BindingDB | Trova dati sull'affinità di legame proteina-ligando. |
binding-affinity, database, drug-discovery |
| Boltz-2 | Predicono strutture biomolecolari e affinità di legame. |
binding-affinity, drug-discovery, protein-folding, structure-prediction, trained-model |
| Cantera | Analizza reazioni chimiche, termodinamica e fenomeni di trasporto. |
cantera, chemical-kinetics, combustionthermodynamics |
| ChemBERTa | Prevede le proprietà molecolari e confronta la somiglianza molecolare. |
cheminformatics, molecular-property-prediction, trained-modeltransformer |
| ChEMBL | Trova dati su composti, bersagli e bioattività. |
bioactivity, cheminformatics, database |
| Chemprop | Predice proprietà molecolari per la ricerca chimica. |
d-mpnn, molecular-properties, property-predictiontrained-model |
| COCONUT | Trova strutture, proprietà e fonti biologiche dei prodotti naturali. |
cheminformatics, database, natural-products |
| Core Python Agent | Analizza le strutture molecolari e le proprietà chimiche. |
cheminformatics, molecular-science, pythonrdkit |
| CREST | Esplora le conformazioni molecolari e lo spazio chimico. |
conformational-search, semiempirical |
| Generatore di molecole De Novo (alimentato da JANUS) | Genera molecole candidate per obiettivi di ricerca specifici. |
de-novo, generative, genetic-algorithm, inverse-design, materials-discovery, molecular-design, selfies |
| &Strumento di previsione del GWP e della durata di vita nell'atmosfera | Prevede il potenziale di riscaldamento globale e la vita atmosferica. |
atmospheric-lifetime, chemistry, chemprop, climate, d-mpnngwp, heat-transfer-fluid, , property-predictiontrained-model |
| KEGG | Trova vie biologiche, reazioni, composti e geni. |
api, bioinformatics, kegg, pathways, reactions |
| Gruppi molecolari | Identifica i gruppi funzionali e i potenziali rischi chimici. |
cheminformatics, functional-groups, safety-screening |
| MolToolkit | Supporta l'analisi molecolare e la chimio-informatica. | cheminformatics |
| Mordred | Descrive le caratteristiche molecolari per prevedere le proprietà. |
cheminformatics, descriptors, mordredqsar |
| nmrglue | Processa e analizza gli spettri di risonanza magnetica nucleare. |
nmr, nmrglue, signal-processingspectroscopy |
| Open Babel | Converte i dati chimici e analizza le strutture molecolari. |
cheminformatics, descriptors, file-conversionopenbabel |
| OPSIN | Interpreta i nomi chimici come strutture molecolari. |
cheminformatics, iupac, name-to-structureopsin |
| PubChem | Trova strutture chimiche, proprietà e informazioni sui composti. |
cheminformatics, database |
| rDock | Prevede le posizioni di docking molecolare per gli studi di legame. |
cheminformatics, docking, rdockvirtual-screening |
| Predittore di retrosintesi (alimentato da RetroChimera) | Predice reazioni chimiche e vie di sintesi. |
computational-chemistry, drug-discovery, gnn, reaction-prediction, retrosynthesis, trained-model |
| RXNMapper | Mappa gli atomi corrispondenti nelle reazioni chimiche. |
atom-mapping, cheminformatics, reactionsrxnmapper |
| TamGen | Genera molecole candidate per siti di legame proteico. |
drug-discovery, generative-model, language-model, molecular-generation, trained-model |
| ToxPred | Prevede la tossicità molecolare e le proprietà correlate alla sicurezza. |
cheminformatics, d-mpnn, property-prediction, safety-assessment, toxicology, trained-model |
| ZINC | Trova composti disponibili commercialmente per lo screening molecolare. |
cheminformatics, compound-search, databasevirtual-screening |
Ingegneria e hardware
Questi agenti supportano la fluidodinamica computazionale, l'analisi e sintesi Verilog, l'analisi temporale statica e la simulazione dei circuiti.
| Agent | Description | Tag di funzionalità |
|---|---|---|
| CFDopenFOAM | Simula il flusso dei fluidi, l'aerodinamica e il trasferimento di calore. |
cfd, computational-fluid-dynamics, engineering, openfoam, simulation |
| OpenSTA-Static-Timing-Analysis | Valuta il comportamento temporale nei progetti di circuiti digitali. |
asic, gf180mcu, netlist, sky130, sta, static-timing-analysis, timing, verilog |
| RTL-IVerilog-Linter | Controlla i design hardware digitali per errori di sintassi. |
eda, hardware-design, iverilog, linting, rtl, systemverilog, verilog |
| Simulatore di transistor Xyce | Simula il comportamento dei circuiti elettronici. |
analog, asic, circuit-simulation, gf180mcu, sky130, spice, transient, xyce |
| Yosys-RTL-Synthesis | Trasforma i progetti hardware digitali in rappresentazioni di circuiti. |
asic, digital-design, rtl, synthesis, verilog |
Genomica e biologia dei sistemi
Questi agenti supportano l'analisi di sequenze biologiche, il recupero di dati genomici, l'analisi dell'espressione genica e la modellazione di reti metaboliche o biochimiche.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| Biopython | Analizza e confronta le sequenze biologiche. |
bioinformatics, biopython, fasta, genbank, sequences |
| COBRApy | Modella le reti metaboliche e valuta gli effetti genici. |
cobrapy, flux-balance, metabolic-modelingsystems-biology |
| COPASI (base) | Simula reti di reazioni biochimiche. |
basico, biochemical-networks, copasisystems-biology |
| Ensembl REST | Trova informazioni su geni, trascrizioni e varianti in diverse specie. |
api, bioinformatics, ensembl, genes, genomics, variants |
| HMMER | Trova sequenze correlate e domini proteici. |
bioinformatics, domains, hmmerprofile-hmm |
| IQ-TREE | Inferisce relazioni evolutive da sequenze biologiche. |
bioinformatics, iqtree, maximum-likelihoodphylogenetics |
| MMseqs2 | Cerca e raggruppa sequenze di proteine e nucleotidi. |
bioinformatics, clustering, mmseqs2sequence-search |
| Allineamento multiplo di sequenze (MAFFT/MUSCLE/Clustal Omega) | Allinea più sequenze proteiche o nucleotidiche. |
alignment, bioinformatics, clustal, mafft, msa, muscle |
| NCBI BLAST+ | Trova somiglianze tra sequenze biologiche. |
alignment, bioinformatics, blastsequence-search |
| Nucleotide Transformer | Analizza sequenze di DNA e potenziali effetti delle varianti. |
bioinformatics, dna-analysis, embeddings, genomics, trained-model, transformer |
| pyOpenMS | Elabora dati di spettrometria di massa per proteomica e metabolomica. |
mass-spectrometry, metabolomics, proteomicspyopenms |
| Analisi RNA-seq | Analizza le differenze di espressione genica e i percorsi correlati. |
bioinformatics, rna-seq, transcriptomics |
| Samtools / BCFtools | Elabora sequenziamenti, allineamenti e dati sulle varianti genetiche. |
alignments, bioinformatics, genomics, samtools, variants |
| Sintetizza bio | Genera profili di espressione genica sintetica per la ricerca. |
bioinformatics, gene-expression, life-sciences, rna-seq, single-cell, transcriptomics |
| Tellurio | Modella il comportamento delle reti biochimiche. |
kinetic-modeling, sbml, systems-biologytellurium |
| UniProt | Trova sequenze proteiche e informazioni funzionali. |
annotations, api, bioinformatics, proteins, uniprot |
| ViennaRNA | Predice le strutture secondarie dell'RNA e le proprietà termodinamiche. |
bioinformatics, rna, secondary-structureviennarna |
Materiali e simulazione
Questi agenti supportano il recupero e l'analisi dei dati dei materiali, le simulazioni atomistiche, la generazione della struttura cristallina e i calcoli di chimica quantistica.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| ASE (Atomic Simulation Environment) | Costruisce e ottimizza strutture atomiche per la simulazione. |
ase, atomistic, materials-scienceoptimization |
| CP2K | Studia le proprietà molecolari e dei materiali attraverso simulazioni quantistiche. |
dft, materials-science, quantum-chemistry |
| DFTB+ | Stima le proprietà quantistiche di molecole e materiali. |
dftbplus, quantum-chemistry, semi-empiricaltight-binding |
| GROMACS | Simula la dinamica molecolare. | molecular-dynamics |
| LAMMPS CPU | Simula il comportamento dei sistemi molecolari e dei materiali. |
materials-science, molecular-dynamics |
| Materials Project | Trova proprietà calcolate di materiali inorganici. |
api, database, materials-project, materials-science, properties |
| Matminer | Descrive le caratteristiche del materiale per l'analisi delle proprietà. |
featurization, machine-learning, materials-sciencematminer |
| Generatore di Cristalli MatterGen | Genera strutture cristalline con proprietà materiali desiderate. |
computational-chemistry, crystal-structure, diffusion-model, generative-model, materials-science, trained-model |
| MDAnalysis | Analizza il moto molecolare e i cambiamenti strutturali nel tempo. |
mdanalysis, molecular-dynamics, trajectory-analysis |
| Phonopy | Studio delle vibrazioni del reticolo e delle proprietà termiche. |
lattice-dynamics, materials-science, phononsphonopy |
| Psi4 | Calcola energie molecolari, strutture e proprietà chimiche. |
ab-initio, dft, quantum-chemistry |
| Pymatgen | Analizza le strutture cristalline, la simmetria e le proprietà dei materiali. |
crystallography, materials-science, pymatgensymmetry |
| PySCF | Calcola le proprietà elettroniche e molecolari. |
dft, hartree-fock, pyscfquantum-chemistry |
| Quantum ESPRESSO | Studia la struttura elettronica e le proprietà dei materiali. |
dft, materials-science, quantum-chemistry |
| spglib | Identifica e analizza la simmetria cristallina. |
crystallography, materials-science, spglibsymmetry |
Proteine e struttura
Questi agenti supportano il recupero della struttura proteica, la previsione, la progettazione, il confronto e l'analisi, insieme alla simulazione biomolecolare.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| AlphaFold | Prevede le strutture delle proteine e dei complessi proteici. |
alphafold, protein-folding, structural-biology, structure-prediction, trained-model |
| AlphaFold DB | Trova strutture proteiche previste e valutazioni di fiducia. |
alphafold, api, protein-structurestructural-biology |
| AmberTools | Simula sistemi biomolecolari e analizza il loro comportamento. |
biomolecular-simulation, molecular-dynamics |
| BoltzGen | Genera e valuta i progetti di binder proteici. |
diffusion-model, generative-model, protein-design, structure-prediction, trained-model |
| DSSP | Identifica le strutture secondarie nelle proteine. |
dssp, secondary-structure, structural-biology |
| Incorporazioni della proteina ESM-2 | Rappresenta sequenze proteiche per l'analisi di somiglianza e struttura. |
bioinformatics, embedding-model, esm2, embeddings, gpu, protein, representation-learning, structure-prediction, trained-model, language-model, transformer |
| Foldseek | Cerca e confronta le strutture proteiche. |
alignment, foldseek, structural-biologystructure-search |
| fpocket | Identifica potenziali tasche di legame per i ligandi nelle proteine. |
binding-site, druggability, fpocketstructural-biology |
| FreeSASA | Misura le aree di strutture proteiche accessibili ai solventi. |
freesasa, sasa, structural-biologysurface-area |
| MODELLER | Costruisce modelli di struttura proteica a partire da strutture correlate. |
homology-modeling, modeller, structural-biology |
| OpenMM | Simula il moto molecolare e analizza il comportamento biomolecolare. |
biomolecular-simulation, gpu, molecular-dynamics |
| P2Rank | Predice i siti di legame dei ligandi nelle strutture proteiche. |
binding-site, machine-learning, p2rankstructural-biology |
| Approfondimenti PDB | Valuta la qualità della struttura proteica e il contesto biologico. |
protein-structure, structural-biology |
| Ricerca PDB | Trova e recupera strutture proteiche determinate sperimentalmente. |
database, protein-structure |
| PLIP (Profiler delle interazioni proteina-ligando) | Caratterizza le interazioni tra proteine e liganti. |
interactions, plip, protein-ligandstructural-biology |
| ProDy | Analizza il movimento delle proteine e la flessibilità strutturale. |
dynamics, normal-mode-analysis, prodystructural-biology |
| RFDiffusion | Progetta strutture proteiche e leganti. |
diffusion-model, generative-model, protein-designtrained-model |
| TM-align / US-align | Allinea le strutture proteiche e misura la somiglianza strutturale. |
structural-biology, structure-alignment, tm-scoretmalign |
Ricerca e dati
Questi agenti supportano revisioni della letteratura, sintesi delle prove, recupero dati per trial clinici, analisi di brevetti e validazione statistica.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| Strumento ricerche Bookshelf | Sintetizza le evidenze di ricerca da fonti di conoscenza allegate. |
knowledge-base, literature-review, research |
| Studi clinici | Trova studi clinici e informazioni sulle sperimentazioni cliniche. |
clinical-trials, database |
| Ricercatore Nexus | Sintetizza pubblicazioni scientifiche per rispondere a domande di ricerca. |
evidence-synthesis, full-text-analysis, literature-review, research, scholarly-publishing |
| Ricercatore online | Esamina la letteratura in ambiti scientifici e ingegneristici. |
literature-review, research |
| Stato dell'arte del brevetto | Confronta le rivendicazioni di brevetto con lo stato della tecnica. |
legal-tech, patent-analysis, prior-art |
| PubMed | Trova letteratura biomedica ed evidenze della ricerca. |
biomedical, literature-search |
| Agente di Validazione Statistica | Valuta i risultati sperimentali e le evidenze statistiche. |
data-analysis, hypothesis-testing, statistics |
Spettroscopia e metabolomica
Questi agenti supportano il confronto spettrale e l'identificazione dei metaboliti.
| Agent | Description | Tag di capacità |
|---|---|---|
| matchms | Confronta gli spettri di massa per l'identificazione dei metaboliti. |
mass-spectrometry, matchms, metabolomicsspectral-similarity |
| SIRIUS | Identifica formule molecolari e strutture metabolitiche candidate. |
mass-spectrometry, metabolomics, siriusstructure-elucidation |