OpenCravat (Open Custom Ranked Analysis of Variants Toolkit)

OpenCRAVAT è un pacchetto Python che esegue l'interpretazione delle varianti genomiche che include impatto, annotazione e assegnazione dei punteggi delle varianti. OpenCRAVAT ha un'architettura modulare con una vasta gamma di moduli di analisi e risorse di annotazione che possono essere selezionati e installati/eseguiti in base alle necessità di uno studio specifico.

Per altre informazioni sui dati, vedere OpenCravat.

Nota

Microsoft fornisce i set di dati aperti di Azure "così come sono". Microsoft non fornisce alcuna garanzia, espressa o implicita, né alcuna condizione in merito all'uso dei set di dati da parte dell'utente. Nella misura consentita dalle leggi locali, Microsoft declina ogni responsabilità per eventuali danni o perdite, inclusi danni diretti, consequenziali, speciali, indiretti, accidentali o punitivi, derivanti dall'uso dei set di dati da parte dell'utente.

Questo set di dati viene fornito in conformità con le condizioni originali in base alle quali Microsoft ha ricevuto i dati di origine. Il set di dati potrebbe includere dati provenienti da Microsoft.

Origine dati

Questo set di dati è un mirror dell'archivio in https://store.opencravat.org e https://run.opencravat.org

Volumi di dati e frequenza di aggiornamento

Questo set di dati include 500 GB di dati e viene aggiornato quotidianamente.

Posizione di archiviazione

Questo set di dati è archiviato nelle aree di Azure Stati Uniti occidentali 2 e Stati Uniti centro-occidentali. L'allocazione delle risorse di calcolo nell'area Stati Uniti occidentali 2 o Stati Uniti centro-occidentali è consigliata per motivi di affinità.

Accesso ai dati

Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset'

Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Token di firma di accesso condiviso: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Condizioni per l'utilizzo

OpenCRAVAT è disponibile con una licenza GPLv3. La maggior parte delle origini dati è gratuita per uso non commerciale. Per l'uso commerciale, consulta i contatti istituzionali per ogni origine dati.

Contatto

rkarchi1@jhmi.edu

Passaggi successivi

Il resto dei set di dati è disponibile nel catalogo dei set di dati aperti.