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Panoramica della trasformazione dei dati DICOM nelle soluzioni dati del settore sanitario

La funzionalità di trasformazione dei dati DICOM nelle soluzioni per i dati sanitari consente di trasferire i dati di Digital Imaging and Communications in Medicine (DICOM) in Fabric OneLake. È possibile inserire, archiviare e analizzare i metadati dell'immagine da varie modalità, ad esempio raggi X, scansioni di tomografia computerizzata (CT) e scansioni di risonanza magnetica (MRI). La funzionalità consente la collaborazione, la ricerca e lo sviluppo (R&D) e l'innovazione dell'IA per diversi casi d'uso di sanità e scienze della vita. L'integrazione tra i dati di imaging e i dati clinici archiviati in formato FHIR (Fast Health Interoperability Resources) consente ai medici e ai ricercatori di interpretare i risultati dell'imaging all'interno del contesto clinico corretto. Questa interpretazione porta a una maggiore accuratezza diagnostica, decisioni cliniche informative e risultati dei pazienti migliorati.

Le pipeline di soluzioni per i dati sanitari consentono di trasformare facilmente i dati DICOM (imaging) in formati tabulari che possono essere mantenuti nel lago in formati FHIR (silver) e OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) (gold). Facilitano l'esecuzione di analisi esplorative e di analitiche di imaging su larga scala e radiomica. Il processo di trasformazione dei dati tramite la pipeline di inserimento di immagini è costituito dalle fasi seguenti:

  1. La pipeline inserisce e rende persistenti i file di imaging DICOM non elaborati, presenti nel formato DCM nativo, nella lakehouse in bronzo.
  2. Estrae quindi i metadati DICOM (tag) dai file di immagini e li inserisce nel bronze lakehouse metastore DICOM per eseguire query semplici.
  3. I dati nel metastore DICOM vengono convertiti in file NDJSON della tabella delta FHIR ImagingStudy , archiviati in OneLake e trasformati in formato FHIR relazionale (silver lakehouse).
  4. Infine, i dati vengono trasformati nella tabella delta Image_Occurrence in formato OMOP (gold lakehouse).

Questa trasformazione facilita scenari come:

  • Condivisione di set di dati di ricerca con il controllo degli accessi in base al ruolo.
  • De-identificazione dei dati testuali e di imaging per la ricerca e la collaborazione.
  • Uso dei dati DICOM per eseguire il training e convalidare i modelli di Machine Learning.
  • Utilizzo dei dati DICOM per condurre studi clinici, analisi cliniche e attività educative.

La trasformazione dei dati DICOM è una funzionalità facoltativa nelle soluzioni per i dati sanitari in Microsoft Fabric. È possibile decidere se usarlo o meno, a seconda delle esigenze o degli scenari specifici.

Per esplorare questa funzionalità e ottenere informazioni sulla distribuzione, la configurazione e l'utilizzo, vedere:

Architettura concettuale

Come spiegato in Architettura dei dati e gestione nelle soluzioni per i dati sanitari, la base della funzionalità si trova nell'architettura del lakehouse medallion. Ecco come questo framework organizza ed elabora i dati DICOM tra i tre livelli lakehouse:

  • Bronzo: questo primo livello archivia i dati dell'immagine di origine nel formato DICOM originale (file DCM) e un metastore che contiene il set completo di metadati (tag DICOM) estratti dai file DCM.

  • Silver: il livello silver (basato sulla specifica FHIR) memorizza i metadati di imaging provenienti dal livello bronze della lakehouse. Archivia anche i collegamenti di file referenziale ai percorsi dei file DCM nel livello bronze. I metadati e i riferimenti ai file di imaging vengono archiviati nella tabella delta ImagingStudy, il cui schema si basa su un formato flat della risorsa ImagingStudy FHIR (R4.3).

  • Oro: il livello oro (basato sulla specifica OMOP) archivia e trasforma i dati di imaging originati dalla tabella delta silver lakehouse ImagingStudy . I metadati di imaging e i riferimenti ai file vengono archiviati nella tabella delta gold Image_Occurrence , il cui schema si basa sull'ultimo sviluppo della standardizzazione dei dati per la ricerca osservazionale basata sull'immagine. Per altre informazioni su questa standardizzazione, vedere OMOP Common Data Model Extension for medical imaging data (Estensione del modello di dati comuni OMOP per i dati di imaging medicale).

Diagramma dell'architettura della soluzione per la funzionalità di trasformazione dei dati DICOM.

Per comprendere in che modo i metadati DICOM vengono trasformati in diversi lakehouse ed esaminare il mapping delle trasformazioni, vedere Mapping della trasformazione dei metadati DICOM nelle soluzioni di dati del settore sanitario.

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