SnpEff: ゲノム バリアントのアノテーションと機能効果予測のツールボックス

  • [アーティクル]

SnpEff 遺伝的バリアントのアノテーションと機能効果予測のツールボックス。 遺伝子やタンパク質に対する遺伝的バリアントの影響 (アミノ酸の変化など) をアノテーションし、予測します。

データの詳細については、ユーザー マニュアルを参照してください。

注意

Microsoft は、Azure Open Datasets を "現状有姿" で提供します。 Microsoft は、データセットの使用に関して、明示または黙示を問わず、いかなる保証も行わないものとし、条件を定めることもありません。 現地の法律の下で認められている範囲内で、Microsoft は、データセットの使用に起因する、直接的、派生的、特別、間接的、偶発的、または懲罰的なものを含めたいかなる損害または損失に対しても一切の責任を負わないものとします。

このデータセットは、Microsoft がソース データを受け取った元の条件に基づいて提供されます。 データセットには、Microsoft が提供するデータが含まれている場合があります。

データ ソース

このデータセットは、 http://downloads.sourceforge.net/project/snpeff/databases/ のミラーです

データ量と更新の頻度

このデータセットには、約 2 TB のデータが含まれており、毎月更新されます。

保存先

このデータセットは米国西部 2 および米国中西部 Azure リージョンに保存されています。 アフィニティのため、米国西部 2 または米国中西部にコンピューティング リソースを割り当てることをお勧めします。

データ アクセス

米国西部 2: 'https://datasetsnpeff.blob.core.windows.net/dataset '

米国中西部: 'https://datasetsnpeff-secondary.blob.core.windows.net/dataset '

SAS Token: sv=2019-10-10&st=2020-09-01T00%3A00%3A00Z&se=2050-09-01T00%3A00%3A00Z&si=prod&sr=c&sig=isafOa9tGnYBAvsXFUMDGMTbsG2z%2FShaihzp7JE5dHw%3D

使用条件

データは制限なく使用できます。 詳細および引用の詳細については、「Accessing and using data in ClinVar」を参照してください。

Contact

このデータセットに関する質問またはフィードバックについては、Pablo Cingolani までご連絡ください。

次の手順

Open Datasets カタログの残りのデータセットを表示します。