Olá Cássio,
è possível de se instalar o Windows via USB, tanto com pendrive bootable quanto com leitores externos.
A alteração que precisa ser feita é na bios, para que o computador inicie primeiramente pelo USB.
Verifique essas informações de como alterar a ordem de boot na bios, no manual do computador ou no site do fabricante do mesmo.
Espero ter ajudado.