Olá, tudo bem?
A pasta de armazenamento de quarentena do Microsoft Security Essentials fica no caminho abaixo:
"C:\ProgramData\Microsoft\Microsoft Antimalware\Quarantine"
Recomendo que não faça alterações manuais nesta pasta, pois pode gerar alguma inconsitência no próprio Security Essentials.
Se você está visualizando esses virus na opção de "Todos os Itens Detectados", verifique também se ele está apontando como Removido.Se estiver, você poderá clicar em "Excluir Histórico", pois este é somente um histórico de seu Security Esssentials.
Se ao clicar em "Itens em Quarentena", você ainda consegue visualizá-los, isto quer dizer que os arquivos infectados ainda estão em seu computador, porém em quarentena. Assim, você poderá excluí-los, selecionando-os e clicando sobre a opção "Excluir".
Mesmo assim, o histórico ainda continuará apontando esta dectecção, e você poderá excluí-la como lhe informei acima.
Qualquer novidade ou dificuldade com o procedimento acima, volte a nos comunicar.
Até mais!