Olá marcstei, Tudo bem?
Bem-vindo à Comunidade da Microsoft.
Sim, é possível formatar o computador com um pen drive bootável.
Neste caso, sugiro que efetue os procedimentos abaixo:
Passo 1: Criar mídia de instalação do Windows.
- Acesse o link: https://www.microsoft.com/pt-br/software-download/windows8
- Clique em Baixar a ferramenta agora.
- Execute o setup baixado.
- Selecione o Idioma, em seguida selecione a edição e a arquitetura de acordo com o Windows 8.1 instalado.
- Conecte o Pen Drive;
- Clique em Avançar;
- Selecione a opção Unidade Flash USB e clique em Avançar.
- Clique em Concluir.
Passo 2: Formatar partição do HD.
- Efetue o boot com o Pen Drive.
- Selecione o Idioma do Windows;
- Clique em Instalar Agora;
- Aceite os Termos d e Licença;
- Clique em Personalizada: instalar apenas o Windows (avançado);
- Selecione a partição do HD e clique em Formatar.
Se esta informação foi útil, por favor, marque como resposta, caso a sua dúvida não tenha sido solucionada, por favor, poste novamente.
Espero ter ajudado, até mais!