Olá RafaelZ, tudo bem?
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Normalmente esse comportamento ocorre quando a ordem de boot está com o pen drive em primeiro na lista, dessa forma, antes mesmo de acessar o disco rígido (HD) ele procura pelo pen drive e por isso só inicia quando ele está conectado.
A minha sugestão inicial é que altere a ordem de boot coloque o HD em primeiro na lista. Encontrei um vídeo que pode ajudá-lo caso não saiba fazer essa alteração: Alterar ordem de boot.
Vale ressaltar que para acessar o SETUP cada fabricante possui uma tecla de atalho, normalmente é o F2 mas, se não for o seu caso, recomendo que verifique no manual ou no site do próprio fabricante do seu PC.
Caso mesmo assim não tenha sucesso recomendo que faça backup dos seus arquivos e faça uma nova instalação limpa, mas dessa vez seguindo os passos dos vídeos dos artigos abaixo:
- Realizando download de instalação de Windows 10 através de um dispositivo USB/DVD.
- Como Instalar Windows 10 efetuando a Instalação Limpa em um PC passo a passo.
Para fazer o backup:
- Após criar a mídia de instalação dê o boot com o pen drive.
- Após dar o boot siga os passos:
- Quando aparecer a janela de instalação clique em Reparar o computador;
- Dentre as opções que se apresentam siga os procedimentos abaixo:
- Clique em Solução de Problemas > Prompt de Comando.
- Quando iniciar o Prompt de Comando digite notepad e pressione Enter.
- Será aberto o Bloco de Notas nele clique em Arquivo > Salvar Como > Disco Local C > Usuários > Seu_Usuário.
- Dessa forma você terá acesso as pastas do seu usuário e pode copiar e colar, por exemplo em um pen drive ou HD externo. Após fazer o backup você pode fazer a instalação limpa normalmente.
Se a resposta ajudou de alguma forma, por favor, marque como resposta, caso a sua dúvida não tenha sido solucionada, por favor, poste novamente.
Espero ter ajudado, até mais!