Olá Henrique, tudo bem?
Obrigado por postar na Comunidade da Microsoft.
Após baixar a imagem do Windows 10 e gravar em um Pendrive / DVD remova o hd do dispositivo deixe somente conectado o SSD faça a instalação do sistema e ao final conecte o HDD novamente.
Referente a sua questão, entendo que queira realizar uma instalação limpa do Windows 10, para isso siga os passos do artigo do link abaixo:
https://answers.microsoft.com/pt-br/windows/for....
Vídeo tutorial: Instalação limpa: https://answers.microsoft.com/pt-br/windows/for....
Faça os backups dos arquivos.
Aguardo novidades.
Se esses procedimentos lhe ajudaram de alguma forma, por gentileza clique em "Resolvi meu problema" e também marque como resposta, assim poderá ajudar outras pessoas.
Espero ter ajudado, até mais!