Oi Fabiano,
Sou David, um Consultor Independente e estou aqui para te ajudar.
A melhor forma é formatar a unidade que contém a instalação do Windows que você deseja remover.
ATENÇÃO: Isso removerá todos os dados da unidade, inclusive arquivos pessoais que possivelmente estejam armazenados nela. Por isso, sugiro que mova seus arquivos pessoais temporariamente para o SSD ou para outra unidade de armazenamento disponível.
Para formatar a unidade, faça o seguinte:
- No Explorador de Arquivos, vá em “Este Computador”;
- Clique com o botão direito na unidade que está com o Windows que você deseja remover e selecione “Formatar…”;
- Deixe as opções padrão, de um nome em “Rótulo do volume” se você quiser e marque “Formatação Rápida”;
- Clique em "Iniciar".
Essa unidade ficará zerada e você poderá criar as pastas da maneira que preferir.
Se continuar solicitando qual Windows você quer iniciar ao ligar o PC. Será necessário ir no "msconfig" e excluir o Windows das configurações de inicialização do sistema.
Me avise se isso for necessário.
Qualquer dúvida ou necessitando de mais informações, estou à disposição.