O primeiro passo vai ser fazer um backup, passe o que deseja salvar para a nuvem ou para um dispositivo de armazenamento externo que não vá usar para configurar o Windows.
Feito isso, crie um pendrive bootável usando o Media Creation Tool (https://www.microsoft.com/pt-br/software-downlo...)
Uma vez criada a imagem no pendrive, faça a instalação do sistema.
Em um dado momento da instalação aparecerá uma lista de drives em que você pode instalar o Windows, a instalação anterior será reconhecida inclusive. Delete todas as partições para evitar a existência de dois Windows na mesma máquina. Crie uma nova partição no novo HD e instale o Windows nela. Habilite o HD atual para que você possa utilizá-lo como armazenamento.
Agora é só prosseguir com os passos até o Windows finalizar a instalação. Depois de feito, volte com seus arquivos que havia feito backup e aproveite sua nova instalação limpa =)