DICOM hizmetini kullanan dijital patoloji

Makale
05/21/2024

Patolojide dijital görüntüleme, laboratuvar dışındaki görüntüleri paylaşmanın, yapay zeka/ML modellerini eğitmek ve dijitalleştirilmiş mikroskop slaytlarını depolamak için bir yol sağlar.

Bu avantajları sağlamak için, birçok kuruluş Tam Slayt Görüntüleme (WSI) dijital slaytlarını DICOM® standart biçimine dönüştürür. Görüntüler DICOM biçiminde olduktan sonra, bunları yaygın radyoloji araçları ve süreçleri kullanılarak yönetilebilecekleri ticari olarak kullanılabilir PACS sistemlerinde depolayabilirsiniz.

Dijital patoloji için DICOM hizmeti

DICOM hizmeti aşağıdakiler gibi benzersiz dijital patoloji gereksinimlerini destekler:

Boyut olarak birden çok GB olan patoloji DICOM örneklerini karşıya yüklemek için gereken ölçek ve performans.
Web görüntüleyicisinin DICOM patoloji görüntülerini gecikme veya bulanıklık olmadan sorunsuz bir şekilde kaydırmasına ve yakınlaştırmasına olanak sağlayan hızlı çerçeve erişimi.
Arşivleme ve araştırma kullanımı için görüntüleri uzun süreli tanılama sonrası depolamanın uygun maliyetli bir yolu.

Sayısallaştırma

DICOM standardı artık tam slayt görüntülerini (WSI) desteklese de, birçok edinme tarayıcısı DICOM biçiminde görüntü yakalamaz. DICOM hizmeti yalnızca DICOM biçimindeki görüntüleri destekler, bu nedenle WSI için diğer biçimlerde bir biçim dönüştürmesi gerekir. Bu biçim dönüştürmelerini gerçekleştirmek için çeşitli ticari ve açık kaynak çözümleri mevcuttur.

Kendi dönüştürücünüzü oluşturmak için bazı örnekler açık kaynak araçları aşağıdadır:

WSIDicomizer

Depolama

Dönüştürülen her WSI, birden çok örneği olan bir DICOM serisiyle sonuçlanır.

Toplu karşıya yükleme

Karşıya yüklenmesi gereken örneklerin daha büyük boyutunu ve sayısını göz önünde bulundurarak, İçeri Aktar'ı kullanarak her serinin toplu karşıya yüklenmesini veya dönüştürülen WSI'lerin toplu olarak yüklenmesini öneririz.

Akış karşıya yükleme

Dönüştürüldükçe her dosyayı karşıya yüklemek istiyorsanız örnekteki STOW tek parça isteğini kullanın.

Önkoşullar

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

Birkaç saniye içinde onlarca GB yüklemesini desteklemeyi test ettik.

Alma

Görüntüleyiciler, DICOM örneğinde çerçeve olarak depolanan kutucukları alır. Her DICOM örneği birden çok çerçeve içerebilir. Daha iyi performans için paralel tek parçalı GET çerçevesi kullanmanızı öneririz.

Önkoşullar

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

İstemciden yaklaşık 60-70ms içinde 60 KB kutucuğun indirilmesini desteklemeyi test ettik.

Görüntüleyiciler

DICOMWeb hizmeti ve OIDC Kimlik Doğrulaması ile yapılandırılabilir herhangi bir WSI Görüntüleyicisi kullanmanızı öneririz.

Örnek açık kaynak görüntüleyici:

Görüntüleyici doğrudan DICOM hizmetiyle etkileşime geçmişse CORS yönergelerini izleyin.

ISV iş ortağı bulma

dicom-support@microsoft.com Uçtan uca çözümler ve destek sağlayan iş ortağı ISV'lerimizle çalışmak istiyorsanız bu bağlantılara ulaşın.

Sonraki adımlar

DiCOM hizmetini Azure'da dağıtma

DICOM hizmetiyle DICOMweb API'lerini kullanma

Not

DICOM® , Tıbbi bilgilerin dijital iletişimleri ile ilgili Standartları yayınları için Ulusal Elektrik Üreticileri Birliği'nin tescilli ticari markasıdır.

Aracılığıyla paylaş