分享方式:


使用 DICOM 服務的數位病理學

病理學中的數位成像提供在實驗室外共用影像、訓練 AI/ML 模型,以及儲存數位化顯微鏡投影片的方法。

為了帶來這些好處,許多組織會將 神秘 投影片圖像處理 (WSI) 數位投影片轉換為 DICOM® 標準格式。 當影像採用 DICOM 格式之後,您可以將它們儲存在商業可用的 PACS 系統中,以便使用常見的放射學工具和程式進行管理。

數位病理學的 DICOM 服務

DICOM 服務支援獨特的數位病理需求,例如:

  • 上傳大小為多個 GB 的病理 DICOM 實例所需的規模和效能。
  • 快速畫面存取,可讓 Web 查看器順暢地平移和縮放 DICOM 病理影像,而沒有延遲或模糊。
  • 儲存用於封存和研究用途之長期診斷影像的符合成本效益的方式。

顯示整個投影片映像數位化和雲端記憶體的圖表。

數位化

雖然 DICOM 標準現在支援全投影片影像 (WSI),但許多下載掃描器不會以 DICOM 格式擷取影像。 DICOM 服務僅支援 DICOM 格式的影像,因此其他格式的 WSI 需要格式轉換。 有數個商業和開放原始碼解決方案可以執行這些格式轉換。

以下是一些 開放原始碼 工具來建置您自己的轉換器的範例:

儲存體

每個轉換的 WSI 都會產生具有多個實例的 DICOM 系列。

批次上傳

考慮到需要上傳的實例大小和數目較大,建議您使用匯入來批次上傳每個數列或一批已轉換的 WSIS。

串流上傳

如果您想要在轉換時上傳每個檔案,請使用範例中的 STOW 單一元件要求。

先決條件

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

我們測試了 幾秒內支持數十 GB 上傳。

擷取

檢視者會擷取儲存為 DICOM 實例中框架的磚。 每個 DICOM 實例可以包含多個畫面。 我們建議使用平行單一部分 GET 框架來提升效能。

先決條件

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

我們測試了 從用戶端下載大約 60-70 毫秒 的 60 Kb 圖格。

檢視者

我們建議使用任何可使用 DICOMWeb 服務和 OIDC 驗證設定的 WSI 查看器。

範例開放原始碼查看器:

如果查看器直接與 DICOM 服務互動,請遵循 CORS 指導方針

尋找ISV合作夥伴

dicom-support@microsoft.com如果您要與我們的合作夥伴 ISV 合作,提供端端端解決方案和支援,請連絡 。

下一步

在 Azure 中部署 DICOM 服務

搭配 DICOM 服務使用 DICOMweb API

注意

DICOM® 是美國電氣製造商協會對於其與醫療資訊數位通訊相關的標準出版物的註冊商標。