BizTalk Server 是一個極其需要大量資料庫的應用程式，可能需要在 SQL Server 中建立最多 13 個資料庫。 因為 BizTalk Server 的主要設計目標之一是確保不會遺失任何訊息，所以 BizTalk Server 會以極大的頻率將數據保存到磁碟，此外，在 MSDTC 交易的內容中也是如此。 因此，資料庫效能對於任何 BizTalk Server 解決方案的整體效能至關重要。
本節說明將 SQL Server 效能最大化的一般方法，以及將 BizTalk Server 環境專屬之資料庫效能最大化的方法。