與 SQL Server 2000 工具的回溯相容性
SQL Server 2005 引進管理 SQL Server 的新工具。SQL Server Management Studio 會取代 SQL Server Enterprise Manager、SQL Query Analyzer、MDX 範例應用程式，以及 Analysis Manager 的某些功能。您無法利用 SQL Server 2000 Enterprise Manager 和 SQL Query Analyzer 來管理較新的版本。
舊式命令提示字元工具
sqlcmd 是用來執行指令碼檔案的命令提示字元工具。目前仍完整支援利用 osql 來連接到 SQL Server。不過，您必須利用 SQL Server 所提供的 osql 版本來執行所有 SQL Server 功能。SQL Server 2000 所提供的 osql 版本會執行相容於 SQL Server 2000 的這些 SQL Server 功能，但部份新功能可能無法使用。
只有 SQL Server 7.0 的通用功能支援利用 isql 來連接到 SQL Server 2005 和較新版本。
不支援利用 Enterprise Manager 來連接到 SQL Server 2005 和較新功能。支援利用 SQL Server 2000 之 Query Analyzer 的 Service Pack 4 版來連接到 SQL Server 和較新版本。
API
請利用 SQL Server Management Objects (SMO) 來開發連接到 SQL Server 2005 和較新版本的應用程式。SMO 取代 SQL Distributed Management Objects (SQL-DMO) 做為慣用的應用程式發展介面 (API) 來開發連接到 SQL Server 的應用程式。SQL Server 仍繼續支援以 SQL-DMO 撰寫的應用程式。
利用 Microsoft Management Console 來管理 SQL Server
SQL Server 組態管理員是一個 Microsoft Management Console (MMC) 嵌入式管理單元，您可以從 [開始] 功能表存取它，也可以將它加入任何其他 MMC 顯示畫面中。您可以利用 SQL Server 組態管理員來啟動、停止、暫停和繼續服務，但您不能利用 SQL Server 組態管理員來管理資料表之類的 SQL Server 物件。SQL Server Management Studio 不使用 MMC，無法加入其他 MMC 工具中。
SQL Server 組態管理員取代了用來設定網路通訊協定的伺服器網路公用程式和用戶端網路公用程式。