Databáze ImmuneCODE

Poznámka:

Důležitá aktualizace z května 2025: Drahá komunita, rádi bychom vás informovali o nadcházející změně týkající se otevřených datových sad Genomics, které jsou aktuálně dostupné prostřednictvím Azure. Po pečlivém zvážení jsme se rozhodli přesunout zaměření na nové iniciativy, které budou lépe sloužit naší komunitě a v souladu s našimi dlouhodobými cíli. Přístup k otevřeným datovým sadám Genomics v Azure bude v nadcházejících měsících ukončen. Chápeme, že tyto datové sady byly cenné pro výzkum, vývoj a učení a velmi si vážíme příspěvků a zapojení naší komunity v průběhu času. Děkujeme vám za pochopení a podporu.

Databáze ImmuneCODE™, která zahrnuje stovky milionů sekvencí T-cell Receptoru (TCR) z více než 1 400 subjektů vystavených nebo napadených virem SARS-CoV-2 a více než 160 000 vysoce důvěryhodných SARS-CoV-2 specifických TCR. Databáze je přístupná bez poplatků. Jejich data je možné analyzovat tak, aby pomohla globálním iniciativám, jejichž cílem je pochopit imunitní reakci na virus SARS-CoV-2 a vytvářet nové zásahy. Další informace o datové sadě najdete v přidružené publikaci.

Nejnovější dostupné datové sady ImmuneCODE obsahují: Release 002.

• 1 486 subjektů vystavených nebo napadených virem SARSCoV-2: ImunitníCODE-Interprety-002.2.
• Ukázková metadata: Imunitní kód-odsud-tags-002.2.tsv (572 kB) verze 002.2.
• Vysoce spolehlivosti SARS-CoV-2 specifické (více než 160 000): ImmuneCODE-MIRA-Release 002.1.
• Ukázková metadata: ImmuneCODE-Repertoire-Tags-002.2.xlsx (352 kB) verze 002.2.

Poznámka:

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets na bázi "tak, jak je". Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné ani předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním zákonem společnost Microsoft odmítá veškerou odpovědnost za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem https://clients.adaptivebiotech.com/pub/covid-2020.

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje přibližně 228 GB dat a aktualizuje se každý den.

Dočasné úložiště

Tato datová sada je uložená v oblastech Azure USA – západ 2. Pro spřažení se doporučuje přidělení výpočetních prostředků v oblasti USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: 'https://dataset1000genomes.blob.core.windows.net/dataset'

USA – středozápad: 'https://dataset1000genomes-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Podmínky použití

Další informace o podmínkách použití dat najdete v publikaci a podmínkách použití.

Kontakt

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7418738/

Další kroky

Prohlédněte si zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.