OpenCravat: Open Custom Ranked Analysis of Variants Toolkit

  • Článek

OpenCRAVAT je balíček Pythonu, který provádí interpretaci genomických variant, včetně dopadu variant, poznámek a bodování. OpenCRAVAT využívá modulární architekturu se širokou škálou analytických modulů a anotačních prostředků, které je možné vybrat a nainstalovat/spustit na základě potřeb konkrétní studie.

Další informace o datech najdete v tématu OpenCravat.

Poznámka

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets podle toho, jak je. Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné nebo předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním právem Společnost Microsoft zřeknutí se veškeré odpovědnosti za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem úložiště na https://store.opencravat.org a https://run.opencravat.org.

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje 500 GB dat a aktualizuje se každý den.

Umístění úložiště

Tato datová sada se uchovává v těchto oblastech Azure: USA – středozápad a USA – západ 2. Kvůli přidružení se doporučuje přidělovat výpočetní prostředky v oblasti USA – středozápad nebo USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: 'https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset'

USA – středozápad: 'https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Token SAS: sv=2020-04-08st&=2021-03-11T23%3A50%3A01Zse&=2025-07-26T22%3A50%3A00Zsr&=csp&=rlsig&=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Podmínky použití

OpenCRAVAT je k dispozici s licencí GPLv3. Většina zdrojů dat je zdarma k nekomerčnímu využití. V případě komerčního využití konzultujte institucionální kontakty pro příslušný zdroj dat.

Kontakt

rkarchi1@jhmi.edu

Další kroky

Zobrazte zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.