Epizoda

**rags2ridges**:A One-Stop-Go for Network Modeling of Precision Matrices

with Carel Peeters

useR!2017: **rags2ridges**:A One-Stop-Go for Netwo...

Klíčová slova: Integrace dat, grafické modelování, odhad vysokorozměrné přesnosti matice; Sítě
Webové stránky: https://CRAN.R-project.org/package=rags2ridges,https://github.com/CFWP/rags2ridges
Kontakt: cf.peeters@vumc.nl
Současné použití inverzních kovariančních matic (neboli přesných matic) se nachází v rekonstrukci sítí založených na datech prostřednictvím grafického modelování. Grafické modely slučují rozdělení pravděpodobnosti náhodných vektorů s grafy, které vyjadřují podmíněné (in)závislosti mezi základními náhodnými proměnnými. Balíček rags2ridges umožňuje odhad přesnosti matice L2 (tj. ridge) v nastavení, kde je počet proměnných velký vzhledem k velikosti vzorku. Jedná se tedy o balíček, ve kterém vysoce dimenzionální data (HD) splňují sítě.
Tato přednáška poskytne přehled balíčku rags2ridges . Konkrétně se zobrazí, že balíček je jedním zastavením, protože poskytuje funkce pro extrakci, vizualizaci a analýzu sítí z dat HD. Kromě toho bude ukazovat, že balíček poskytuje základ pro vertikální (napříč datovými sadami) a horizontální integraci dat HD pocházejících z experimentů s omics . V neposlední řadě to vysvětlí, proč mnoho rapových hudebníků říká, že jeden by měl "dostat ridge, nebo umřít".
Odkazy https://arxiv.org/abs/1509.07982
https://arxiv.org/abs/1608.04123
http://dx.doi.org/10.1016/j.csda.2016.05.012