SnpEff: Genomikus változatjegyzetek és funkcionális effektus-előrejelzési eszközkészlet

  • Cikk

SnpEff Variánsannotációhoz és hatás-előrejelzésre használható eszközkészlet. Gének és fehérjék genetikai variánsainak hatásait (például aminosav-változások) annotálja és előrejelzi.

Az adatokkal kapcsolatos további információkért tekintse meg a felhasználói kézikönyvet.

Megjegyzés:

A Microsoft az Azure Open Datasets szolgáltatást "adott módon" biztosítja. A Microsoft nem vállal kifejezett vagy vélelmezett garanciát vagy feltételeket az adathalmazok Ön általi használatára vonatkozóan. A microsoft a helyi jogszabályok által megengedett mértékben kizár minden felelősséget az adathalmazok használatából eredő károkért vagy veszteségekért, beleértve a közvetlen, következményi, különleges, közvetett, incidenses vagy büntető jellegű károkat is.

Az adatkészletet a Microsoft forrásadataihoz tartozó eredeti feltételek szerint szolgáltatjuk. A készlet tartalmazhat Microsofttól származó adatokat.

Adatforrás

Ez az adathalmaz a http://downloads.sourceforge.net/project/snpeff/databases/ tükrözése.

Adatkötetek és frissítés gyakorisága

Ez az adathalmaz körülbelül 2 TB méretű adatot tartalmaz, és havonta frissül.

Tárolási hely

Az adatkészlet tárolási helye az USA 2. nyugati régiója és az USA nyugati középső régiója. Az affinitás érdekében az USA 2. nyugati régióján és az USA nyugati középső régióján belüli számítási erőforrások lefoglalását javasoljuk.

Adathozzáférés

USA 2. nyugati régiója: "https://datasetsnpeff.blob.core.windows.net/dataset"

USA nyugati középső régiója: "https://datasetsnpeff-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

SAS-token: sv=2019-10-10&st=2020-09-01T00%3A00%3A00Z&se=2050-09-01T00%3A00%3A00Z&si=prod&sr=c&sig=isafOa9tGnYBAvsXFUMDGMTbsG2z%2FShaihzp7JE5dHw%3D

Használati feltételek

Az adatok korlátozások nélkül felhasználhatók. További információ és idézet részletei: Adatok elérése és használata a ClinVarban.

Kapcsolat

Ha bármilyen kérdése vagy visszajelzése van az adatkészletről, forduljon Pablo Cingolanihoz.

További lépések

Tekintse meg a többi adathalmazt az Open Datasets katalógusban.