とりあえずは指示に従い、C:ドライブのディスクのチェックを行ってみたほうがいいと思いますが、C:\Windows\FontsフォルダにはWindowsで使うフォントファイルが格納されていますし、他のフォルダなどでも実は問題は発生しているかもしれませんので、最悪Windowsの再インストールが必要になる場合もあると思います。
できれば必要なデータは事前にバックアップしてからの方がいいと思います。
[ディスクのチェック手順]
・[マイ コンピュータ]などからC:ドライブを右クリックし[プロパティ]を表示します
・[ツール]タブのエラーチェックにある[チェックする]ボタンをクリックします
・[ファイル システム エラーを自動的に修復する]をチェックし、[開始]ボタンをクリックします
・「次回の再起動時に実行しますか」という内容のメッセージが表示されたら[はい]で答えて、再起動します
※コマンドプロンプトで、chkdsk c: /f コマンドでも可能です
頻繁にこのような状態になるのであれば、HDDの状態自体に何らかの問題がある可能性も否定できません(もりろん必ずしもHDDに原因があるともいえませんが・・・)。