質問内容だけではよく分かりませんが、次のことを行ってみたらどうでしょうか。
念のため、大切なデーターがある場合はバクアップしておいたほうがいいと思います。
HDDの空き容量が少ないようであれば、データーの移動などで空き容量を増やす。
Windows 7
であれば通常は必要がない操作ですが、確認のためディスク
デフラグを行ってみる。
ハードディスクのデフラグ(最適化)を行う方法
HDDの接続先SATAポートを変えて(空きがなければ入れ替えて確認して)みる。
ドライブの容量が分かりませんが、チェックディスクが数分で終わったということであれば、「ファイルシステムエラーを自動的に修復する」と「不良セクターをスキャンし、回復する」にチェックしてから実行する。
なお、HDDの状況によっては起動不能になる可能性もあるので、大切なデーターはバックアップしておく方がいいと思います。
ハードディスクのエラーをチェックする方法
HDDが劣化している可能性もあります。
目安にしかならないかもしれませんが、S.M.A.R.T情報を確認してみたらどうでしょうか。
CrystalDiskInfo
なお、大容量のファイルであれば時間がかかる場合がありますが、そのような理由で遅いということではなく、他のHDDに比べて遅いということでしょうか。
また、今までは問題がなかったものがある時期から遅くなったということでしょうか。
「遅い」という状況をもう少し詳しく投稿すればアドバイスが得られやすいかもしれません。
また、下のサイトを参考に確認してみたらどうでしょうか。
CrystalDiskMark